Spezialvorlesung
Einführung in die Bioinformatik
Mo. 12:15-13:45 und Di. 16:15-17:45 in HG1 HS2
Inhaltsübesicht
Literatur
- Die Vorlesung stützt sich teitweise auf das folgende Buch. R.Durbin, S.Eddy, A.Krogh, G.Mitchison: Biological sequence analysis. Probability models of proteins and nucleic acids. Cambridge Univ. Press 1998 (2.Auflage 1999).
- Weiterfüherendes zum Thema Pattern-Matching findet man in den Büchern von Aho, Hopcroft und Ullmann The Design and Analysis of Computer Algorithms und von Cormen, Leiserson und Rivest Introduction to Algorithms.
- Zur Support-Vektor-Methode kann man in das Buch Support Vector Machines von Nello Christianini
und John Shawe-Taylor schauen.
Zur Vorlesung wird ein Skript erstellt.
- Teil 1 als PS und PDF.
- Eine Vorversion von Teil 2 als PS und PDF.
- Eine Vorversion des Kapitels zur Support-Vektor-Methode (SVM) als PS.
Bitte schickt Fehler, Wünsche und Fragen an Paul Fischer.
Der JAVA-Quellcode für den KMP- und BM-Algorithmus in einer
ZIP-Datei.
Die Dateien müssen
in ein Verzeichnis mit dem Namen bioinf kopiert werden! Alle
Programme dienen nur zur Demonstration.
Stand 08.11.2001