Blockseminar Bioinformatik

im Sommersemester 2003

Veranstalter: PD Dr. Thomas Hofmeister, Lehrstuhl 2


Thema

Biotechnologie, Genomforschung, Drug Design, Sequenzanalyse, Proteinsynthese, Docking-Probleme - alles Probleme aus der Biologie und der Pharmazie, die nicht mehr ohne Informatikmethoden zu bearbeiten sind. Daher ist Bioinformatik eine neue Disziplin mit großer Wachstumsrate und es gibt bereits ein paar Universitäten mit dem Studiengang Bioinformatik.

In der Bioinformatik stellen sich viele algorithmische Probleme, der Entwurf und die Analyse von Algorithmen sowie Fragen der Problemmodellierung spielen also eine zentrale Rolle.

Die Probleme, die dabei betrachtet werden, lassen sich im Prinzip rein kombinatorisch formulieren (so, wie man auch in anderen Bereichen praktisch relevante Probleme auf kombinatorische Probleme wie das Cliquenproblem reduzieren kann).

Man benötigt also eigentlich kein Hintergrundwissen aus der Biologie selbst, es sei denn, man bedarf einer Motivation, warum dieses oder jenes Problem wichtig ist.

Für uns heißt das auf jeden Fall: Es werden keine Vorkenntnisse aus der Biologie für die Teilnahme am Seminar benötigt. (Der Veranstalter verfügt ja auch selbst über keine solchen.)


Das Seminar baut auf dem Buch "Bioinformatik interaktiv - Algorithmen und Praxis" von R. Merkl und S. Waack auf.

Geplant ist, dass alle Teilnehmer am Seminar die (einfachen) einleitenden Kapitel lesen, da sie Voraussetzung für die späteren Kapitel sind. Über diese Kapitel wird es dann keine Vorträge geben.

Für die späteren Kapitel soll sich jeweils ein(e) Vortragende(r) finden, die/der das entsprechende Kapitel aufbereitet und ggf. durch anderes Material aus dem Internet ergänzt.

Es wäre schön, wenn sich die Studenten/innen, die zur Vorbesprechung erscheinen, vielleicht vorher schon das Inhaltsverzeichnis des o.g. Buches anschauen, um schon ein Gefühl dafür zu bekommen, welches Thema für sie interessant sein könnte.